电离净水装置由一台控制器和一套电极组成，电极分为铜、银电极两种；铜银电极分别放置在循环水中，控制器向电极发出*的直流信号。

当铜、银离子进入水中，带正电荷的铜离子和银离子在微生物的细胞壁上的负电荷区域形成静电键，产生杀菌灭藻，净化水质的作用。这些静电键产生的压力导致扭曲的细胞壁具有渗透性，并减少维持细胞生命的营养素的摄取。一旦进入藻类细胞内部，铜和银就攻击包含有氨基酸残基的硫，这个硫存在于用于光合作用的蛋白质中。那么光合作用停止，从而导致细胞死亡。

电离净水装置为存在于水中的离子提供一个保护，它们提供长期的、无毒的净化，并阻止污染再次的发生。与其他大多数消毒剂不同，铜银离子一直存在于水中，直到它们凝聚起来，或者形成带有藻类和细菌的包块，然后当变得足够大的时候被过滤设备清除掉。